四年前に京で会った越五屋の主人、三津井庄右衛門から、ある日、平賀源内に思いもかけない依頼が舞い込む―。息子・庄九郎救出のため、漂着したという南の島への探索をしてほしいというのだ。島から唯ひとり生還した水夫によれば、向かうべき島は「ニルヤカナヤ」。黄金の島で、龍が棲むという。同じ情報を得た和蘭陀国、盗賊・火鼠の一味も加わり、三つ巴の野望が渦巻く中、源内は、三国船「ゑれき丸」を完成させ、杉田玄白らとともに江戸を発つ。そして立ち寄った琉球で、江戸学者を名のる老人・牧志朝典から加良間に伝わる祭りと目蓋のないユタの話を聴く。